為提昇台灣東部學術及文化水準，提升東部產、經、學發展，政府斥資於民國八十三年七月一日成立國立東華大學，作為東部第一所綜合大學。

國立東華大學化學研究所成立於民國八十五年 ，招收碩士班研究生，八十七學年成立化學系，招收大學部學士班，九十學年成立化學研究所博士班。目前師資共計18人，計有教授7名，副教授6名，助理教授2名，助教2名，行政助理2名 。

本系目前已成立大學部學士班，計有人數196人，研究所碩士班，計有人數85人，研究所博士班，計有人數23人。

除了全方位傳統基礎領域之教學與研究訓練外，因應全球科技產業之發展趨勢，研究之重點 特別重(但不限)於生物科技與材料科技；跨領域整合是另一大方向，與物理、生命科學、資訊工程、電機工程、應用數學、材料科學與工程系等共同開設(1) 生物資訊學與(2) 奈米科技學程；和物理系、材料系共同成立"奈米科技研究中心"。

教學部份共有普通化學、有機化學、分析化學、物理化學、儀器分析化學等教學實驗室，並設有600MHz核磁共振儀、氣相層析質譜儀、紅外光譜儀等實驗室等等。

大學部傳授堅實之基礎化學知識，包含物化、分析、有機、無機、生化等課程，並結合嚴謹之實驗教學訓練；同時鼓勵高年級學生參予專題研究，實際參與比例亦高。

研究所因應現代科技發展之多樣性與跨領域整合的兩大特性，因此開設多種相關專業課程，如奈米科技、質譜分析、酵素化學、化學感測器…等 ，以期提升畢業生的專業知識。