原住民民族學院正式成立於民國90年8月，是國內第一所培育原住民人才並以原住民文化為研究主體的學院。其前身為原住民民族學苑籌備處，由行政院原住民族委員會主委及國立東華大學校長於86年12月18日共同簽約並掛牌成立。歷經三年多等備有成，而於90學年度開始招收第一屆大學部及碩士班新生。

本院創設初期即設立兩系兩所及一中心：民族文化學系、民族語言與傳播學系、民族發展研究所、族群關係與文化研究所、原住民研習中心。其中族群所早在84年本校創校之初即已設立，原隸屬文學院；原住民研習中心則延續民族學苑籌備處的功能，結合社會資進行原住民推廣教育之教學、研究與服務。

93學年度起本院增設民族藝術研究所；94學年度增設族群所博士班，未來並可望設立民族事務與發展學系、民族藝術學系等。

本院發展重點包括：培育具專業倫理之原住民人才、推動民族發展研究並提供政策諮詢、維護並發展原住民族文化、推展社區發展與服務、建立國際南島民族研究中心等。目前全院專任教師共二十一位，其中教授五名，副教授三名，助理教授十三名，另聘有原住民族語協力教師若干名。

本院為培育多方位人才，已設有原住民語言與文化學程及原住民藝術創意產業發展學程，未來並將朝向學群制規劃，讓學生依據個人的興趣，更自由的選擇修習課程。預期在本院硬體建築工程完工後，將提供師生更為完善的教學、研究、實習、展演之空間與設備，讓本院在多元文化的匯集與激盪下，綻放出璀璨的學術光茫。